ও基于质谱的卵白判定和表征战略是，卵白质从生物样本中提取出来后接纳自下而上或自上而下的阐发方式。前者，庞杂夹杂物中的卵白质经过过程酶解后可以或许被多肽指纹质谱间接收罗或进一步在线分手后经串连质谱阐发。而鸟枪法是将卵白质夹杂物完全酶解为大批肽段后，应用多维度液相分手后经串连质谱阐发。后者，庞杂的卵白质夹杂物经过分级纯化为单一卵白质组分或较为简略的卵白质夹杂物，随后离线打入质谱中停止完全卵白丈量和破裂阐发。此刻，迷信家们经常接纳在线的液相质谱手艺停止大行列卵白质组学断定。
经典故事自下而上质谱卵白质组阐发竞争战略：
l 𝕴鸟枪法，亦称发明人卵白质组。其发生了的数据源库可不可以虽然停止工作怪物范本中复杂的条数的卵白质判断，应对较高品貌的卵白质阐发再次出现性很是好。
l 对比研制成功卵白质组原则，清楚标底作用地鉴定、参考值阐发其他的预定卵白质组，原则复现性极佳。
l 靶向药物卵白质组以更高的检查舒经度和冗余规模性酶联免疫法阐发后来筛选的小片断卵白质组。
l 悦纳自己DIA阐发的质谱实验仪器，因此判断样例中往往卵白质已成为会。
